Именно через Lua я и заставляю черепашку установить чанкдодер и загрузить его топливом.
Можно. Забираем мировой якорь с помощью turtle.dig(), перемещаемся в нужную позицию, устанавливаем с помощью turtle.place(), и закидываем жемчуг с помощью turtle.drop(). Всё работает как часы.
Но есть нюанс. Любой чанклодер не мешает выгрузке чанков при перезагрузке сервера. Поэтому, чтобы черепашки не заблудились, они должны закончить добычу до рестарта сервера. Роботы OpenComputers лишены этого недостатка, они более устойчивы к выгрузкам чанков.