Видимо, то, что ls /home не будет показывать программу, а будет показывать только созданные пользователем файлы.
Я всё-таки предпочту давать пользователю выбор: пусть куда хочет, туда и ставит.
Если юзеру важно, куда именно прога скачается - пусть пишет
mkdir /usr/bin && cd /usr/bin
, благо программы обычно не очень часто ставятся. Может, этот пользователь захочет вовсе в /bin программу поставить.